När de inte används under längre perioder bör avfallsförbränningsugnar förvaras i en torr, välventilerad miljö för att förhindra korrosion och rost orsakad av fukt, regn eller hög luftfuktighet. Förvaringsplatsen bör vara platt, fast och borta från brandfarliga, explosiva eller frätande ämnen för att garantera säkerheten. Långvarigt direkt solljus bör också undvikas för att förhindra åldrande av utrustningens hölje och gummitätningar.
Före lagring bör utrustningen rengöras noggrant för att avlägsna aska, avloppsvatten och föroreningar från ugnen, askavskiljningssystemet och avgasrören. Viktiga metallkomponenter, särskilt förbränningskammarhöljet, fläktlager och avgasrör, kan beläggas med rostskyddsolja eller rostskyddsbeläggning. För utrustning som lagras under långa perioder kan den täckas med plastfilm eller ett dammskydd för att förhindra att damm och föroreningar kommer in i utrustningen.
Under lagring bör utrustningen inspekteras regelbundet, helst var 1–3 månad. Kontrollera tätningar, ventiler, fläktar och elektriska styrsystem för integritet; åtgärda eventuell rost eller lossning omedelbart. Smörj lätt de roterande nyckeldelarna för att förhindra att de fastnar eller skadas på grund av långvarig inaktivitet. Registrera inspektionsresultaten för att säkerställa att utrustningen är i gott skick innan den återanvänds.